Der Võrtsjarv See ist der größte See innerhalb der Grenzen Estlands (270 km²). Trotz seiner großen Oberfläche ist der See mit einer durchschnittlichen Tiefe von nur 2,8 m sehr flach. 35 Fischarten kommen im Võrtsjärv See vor, wie Barsche und Plötze sowie die auch kommerziell wichtigen Fischarten Zander, Aale, Brachsen und Hechte. Der See ist ein bedeutendes Habitat für Brutvögel, z.B. Trauerseeschwalben, wie auch für Zugvögel, z.B. Singschwäne, Kraniche, Pfeifenten, Bergenten und Bruchwasserläufer.