Zu den Säugetieren des Parks gehören Biber, Fischotter und Elche. Biber machen sich ökologisch verdient, indem sie zum Beispiel einen Entwässerungskanal aufstauen und damit neue Feuchtgebiete schaffen. Brutvögel sind im Park unter anderem (in Paaren): 5 Prachttaucher, 10 Alpenstrandläufer, 15 Fischadler, 5 - 7 rufende Rohrdommeln, 50 Kraniche, 1 - 2 Schwarzstörche, 20 Eisvögel, 10 rufende Tüpfelsumpfhühner und 100 Individuen des Birkhuhns. Nirgends brüten in Europa so viele Weißstörche pro Quadratkilometer wie in Litauen.
Ähnlich reichhaltig wie die Tierwelt ist die Pflanzenwelt im Regionalpark Labanoras. So zählten Botaniker 120 Büsche der Heidelbeerweide, 300 Blütenstengel des Blauen Tarants, 80.000 des Fuchsschen Knabenkrauts, 2.300 der Wasser-Lobelie und 200 Blüten der Zwerg-Teichrose.