Das Pantanal wird geprägt durch unzählige Seen, Flüsse und Tümpel, die sich zwischen immergrünem Regenwald, Trockenwäldern und Savannen erstrecken. Die Flüsse Paraguay, Cuiabá und Taquari sind die Hauptschlagadern des Überschwemmungsgebietes. Rund 90 % des Gebietes liegen in den brasilianischen Bundesstaaten Mato Grosso und Mato Grosso do Sul. Das Pantanal erstreckt sich in die westlich gelegenen Nachbarstaaten Paraguay und Bolivien.
665 verschiedene Vogel-, 265 Fisch-, 123 Säugetier- und über 1.700 Pflanzenarten sind der Grund, warum das Pantanal von den Brasilianern auch als „Garten Eden" bezeichnet wird. Zu den prominenten Bewohnern aus der Tierwelt zählen Jaguar, Ozelot und Brillenkaiman. Der riesige Jabiru-Storch, auch Tuiuiú genannt, ist das Symbol des Pantanals. Der vom Aussterben bedrohte Hyazinth-Ara kommt hier noch in größeren Kolonien vor.