Im Wilson Inlet ist eine Vielzahl an Fischen beheimatet: Sprotte (Hyperlopus vittatus), Welsart (Cnigoglnis macrocephalis), Goldbrasse (Chrysophrys auratus), Meeräsche (Mugil cephalus) und Makrele (Scomber australasicus).
Eine große Artenvielfalt an Wasservögeln kommt in und am Wilson Inlet vor: Brillenpelikan (Pelecanus conspicillatus), Schwarzscharbe (Phalacrocorax sulcirostris) und Australische Zwergscharbe (Phalacrocorax melanoleucus), Trauerschwan (Cygnus atratus), Weißkehlenente (Anas gibberifrons), Halbmondlöffelente (Anas rhynchotis), Schwarzkinn-Ruderente (Oxyura australis), Rotkopf-Säbelschnäbler (Recurvirostra novaehollandiae) und Rotschnabelmöwe (Larus novaehollandiae).
Rund um das Wilson Inlet leben auch viele Arten von Landvögeln, Säugetieren und Reptilien. Vögel wie Graurücken-Brillenvogel (Zosterops lateralis), Gelbwangensittich (Platycerus icterotis), Weißaugen-Honigfresser (Phylidonyris novaehollandiae), Eulenschwalm (Podargus strigoides), Ringsittich (Barnardius zonarius), Blauscheitellori (Glossopsitta porphyrocephala) und Rotkappensittich (Purpureicephalus spurius) haben hier ihre Heimat. Gelbfuß-Beutelmaus (Antechinus flavipes), Honigbeutler (Tarsipes rostratus) und Schmalfuß-Beutelmaus (Sminthopsis griseoventer) sind Säugetiere, die im Umland von Wilson Inlet leben. Auch Reptilien wie Australische Scheinkobra (Pseudodonaja affinis) und Tigerotter (Notechis sscutatus) sind hier anzutreffen.